Sezon nurkowy w rejonie Sipadanu trwa praktycznie przez cały rok. Uważa się, że najlepsze warunki panują od kwietnia do października, kiedy występuje tam pora sucha, ale z własnego doświadczenia wiemy, że i w czasie zimowych miesięcy pobyt może być fantastyczny. Z pogodą... wiadomo - jest nieprzewidywalna. W najgorszym razie trzeba spodziewać się przelotnych deszczy. Temperatura wody wynosi od 26-27°C w miesiacach zimowych do 29°C latem.